In de tweede vrije training wist Kenan Sofuoglu van het Ten Kate team eindelijk zijn draai te vinden op het circuit van Valencia en pakte gelijk de snelste tijd in deze tweede vrije training. De tweede tijd werd gehaald door Fujiwara gevolgd door David Salom op de drie cilinder Triumph Daytona 675.
Lascorz die in de eerste kwalificatie nog een tweede tijd wist te behalen is afgezakt naar een vierde tijd, doordat hij zijn tijd niet wist te verbeteren.
1 54 Sofuoglu K. (TUR) Honda CBR600RR 1’36.013
2 37 Fujiwara K. (JPN) Kawasaki ZX-6R 1’36.457
3 25 Salom D. (ESP) Triumph Daytona 675 1’36.659
4 26 Lascorz J. (ESP) Kawasaki ZX-6R 1’36.733
5 51 Pirro M. (ITA) Honda CBR600RR 1’36.752
6 50 Laverty E. (IRL) Honda CBR600RR 1’36.926
7 7 Davies C. (GBR) Triumph Daytona 675 1’37.218
8 99 Foret F. (FRA) Kawasaki ZX-6R 1’37.383
9 40 DiSalvo J. (USA) Triumph Daytona 675 1’37.624
10 5 Lundh A. (SWE) Honda CBR600RR 1’37.746
11 14 Lagrive M. (FRA) Triumph Daytona 675 1’37.840
12 127 Harms R. (DEN) Honda CBR600RR 1’37.884
13 55 Roccoli M. (ITA) Honda CBR600RR 1’38.003
14 117 Praia M. (POR) Honda CBR600RR 1’38.345
15 8 Chesaux B. (SUI) Honda CBR600RR 1’38.819
16 4 Rea G. (GBR) Honda CBR600RR 1’38.908
17 9 Dell’Omo D. (ITA) Honda CBR600RR 1’39.506
18 33 Cazzola P. (ITA) Honda CBR600RR 1’40.654
19 24 Blokhin E. (RUS) Yamaha YZF R6 1’43.438
20 85 Palumbo A. (ITA) Kawasaki ZX-6R 1’46.260